MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3

Total Repeats: 3475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009928	AGG	2	6	334	339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340457
2	NC_009928	TGC	2	6	395	400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340457
3	NC_009928	CAG	2	6	430	435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340457
4	NC_009928	CTT	2	6	504	509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340458
5	NC_009928	AGC	2	6	517	522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340458
6	NC_009928	AGCT	2	8	796	803	25 %	25 %	25 %	25 %	158340458
7	NC_009928	TGA	2	6	809	814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340458
8	NC_009928	A	6	6	980	985	100 %	0 %	0 %	0 %	158340458
9	NC_009928	AAT	2	6	1026	1031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340458
10	NC_009928	CAATC	2	10	1104	1113	40 %	20 %	0 %	40 %	158340458
11	NC_009928	CGAT	2	8	1151	1158	25 %	25 %	25 %	25 %	158340458
12	NC_009928	TGT	2	6	1181	1186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340458
13	NC_009928	CAGC	2	8	1240	1247	25 %	0 %	25 %	50 %	158340458
14	NC_009928	CT	3	6	1538	1543	0 %	50 %	0 %	50 %	158340459
15	NC_009928	CT	3	6	1565	1570	0 %	50 %	0 %	50 %	158340459
16	NC_009928	CT	3	6	1576	1581	0 %	50 %	0 %	50 %	158340459
17	NC_009928	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340459
18	NC_009928	TGA	2	6	1620	1625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340459
19	NC_009928	ATT	2	6	1626	1631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340459
20	NC_009928	T	6	6	1690	1695	0 %	100 %	0 %	0 %	158340459
21	NC_009928	CGA	2	6	1714	1719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340459
22	NC_009928	ATTT	2	8	1807	1814	25 %	75 %	0 %	0 %	158340459
23	NC_009928	T	7	7	1812	1818	0 %	100 %	0 %	0 %	158340459
24	NC_009928	GAG	2	6	1907	1912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340459
25	NC_009928	TCT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340459
26	NC_009928	A	6	6	1921	1926	100 %	0 %	0 %	0 %	158340459
27	NC_009928	CTT	2	6	2204	2209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340460
28	NC_009928	CTT	2	6	2698	2703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340461
29	NC_009928	AGC	2	6	2707	2712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340461
30	NC_009928	CT	3	6	2773	2778	0 %	50 %	0 %	50 %	158340461
31	NC_009928	CTT	2	6	2784	2789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340461
32	NC_009928	GCT	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340461
33	NC_009928	CAT	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340461
34	NC_009928	GAGC	2	8	2985	2992	25 %	0 %	50 %	25 %	158340461
35	NC_009928	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340461
36	NC_009928	ATCA	2	8	3292	3299	50 %	25 %	0 %	25 %	158340462
37	NC_009928	TTC	2	6	3315	3320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340462
38	NC_009928	TTC	2	6	3344	3349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340462
39	NC_009928	CTC	2	6	3350	3355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340462
40	NC_009928	T	6	6	3425	3430	0 %	100 %	0 %	0 %	158340462
41	NC_009928	GCAA	2	8	3515	3522	50 %	0 %	25 %	25 %	158340462
42	NC_009928	CTC	2	6	3554	3559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340462
43	NC_009928	TGGA	2	8	3600	3607	25 %	25 %	50 %	0 %	158340462
44	NC_009928	AC	3	6	4029	4034	50 %	0 %	0 %	50 %	158340464
45	NC_009928	TGA	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340464
46	NC_009928	AGGG	2	8	4193	4200	25 %	0 %	75 %	0 %	158340464
47	NC_009928	GTT	2	6	4221	4226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340464
48	NC_009928	GA	3	6	4271	4276	50 %	0 %	50 %	0 %	158340464
49	NC_009928	AATA	2	8	4308	4315	75 %	25 %	0 %	0 %	158340464
50	NC_009928	TAG	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340464
51	NC_009928	CCT	2	6	4400	4405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340464
52	NC_009928	TAAA	2	8	4458	4465	75 %	25 %	0 %	0 %	158340464
53	NC_009928	A	7	7	4476	4482	100 %	0 %	0 %	0 %	158340464
54	NC_009928	T	6	6	4546	4551	0 %	100 %	0 %	0 %	158340464
55	NC_009928	GCA	2	6	4555	4560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340464
56	NC_009928	CCA	2	6	4636	4641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340464
57	NC_009928	CTG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340464
58	NC_009928	TTC	2	6	4734	4739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340464
59	NC_009928	CCAT	2	8	4775	4782	25 %	25 %	0 %	50 %	158340464
60	NC_009928	TAC	2	6	4784	4789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340464
61	NC_009928	AATC	2	8	4948	4955	50 %	25 %	0 %	25 %	158340465
62	NC_009928	TGA	2	6	4984	4989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340465
63	NC_009928	GGA	2	6	5078	5083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340465
64	NC_009928	GA	3	6	5120	5125	50 %	0 %	50 %	0 %	158340465
65	NC_009928	TGG	2	6	5164	5169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340465
66	NC_009928	ATG	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340465
67	NC_009928	TGA	3	9	5406	5414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340466
68	NC_009928	TCGT	2	8	5512	5519	0 %	50 %	25 %	25 %	158340466
69	NC_009928	AGT	2	6	5545	5550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340466
70	NC_009928	GTCA	2	8	6030	6037	25 %	25 %	25 %	25 %	158340467
71	NC_009928	GA	3	6	6050	6055	50 %	0 %	50 %	0 %	158340467
72	NC_009928	AG	3	6	7002	7007	50 %	0 %	50 %	0 %	158340468
73	NC_009928	CTT	2	6	7083	7088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340468
74	NC_009928	CAG	2	6	7108	7113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340468
75	NC_009928	TCG	2	6	7130	7135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340468
76	NC_009928	GTCG	2	8	7175	7182	0 %	25 %	50 %	25 %	158340468
77	NC_009928	CT	3	6	7197	7202	0 %	50 %	0 %	50 %	158340468
78	NC_009928	ACCTC	2	10	7493	7502	20 %	20 %	0 %	60 %	158340468
79	NC_009928	ATT	2	6	7547	7552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340468
80	NC_009928	TGG	2	6	7716	7721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
81	NC_009928	TGA	2	6	7754	7759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340468
82	NC_009928	GAT	2	6	7764	7769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340468
83	NC_009928	CAG	2	6	7848	7853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340468
84	NC_009928	ACTC	2	8	7865	7872	25 %	25 %	0 %	50 %	158340468
85	NC_009928	CAA	2	6	7914	7919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340468
86	NC_009928	ACCC	2	8	7920	7927	25 %	0 %	0 %	75 %	158340468
87	NC_009928	C	6	6	7925	7930	0 %	0 %	0 %	100 %	158340468
88	NC_009928	CTGC	2	8	7983	7990	0 %	25 %	25 %	50 %	158340468
89	NC_009928	CGC	2	6	8019	8024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340468
90	NC_009928	AT	3	6	8060	8065	50 %	50 %	0 %	0 %	158340468
91	NC_009928	AGA	2	6	8103	8108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
92	NC_009928	AC	3	6	8124	8129	50 %	0 %	0 %	50 %	158340468
93	NC_009928	AGC	2	6	8139	8144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340468
94	NC_009928	GCC	2	6	8152	8157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340468
95	NC_009928	ACA	3	9	8181	8189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340468
96	NC_009928	CTCAT	2	10	8241	8250	20 %	40 %	0 %	40 %	158340468
97	NC_009928	GGA	2	6	8433	8438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340468
98	NC_009928	ATGG	2	8	8883	8890	25 %	25 %	50 %	0 %	158340468
99	NC_009928	AAG	2	6	9066	9071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
100	NC_009928	GCT	2	6	9307	9312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340468
101	NC_009928	TGA	2	6	9317	9322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340468
102	NC_009928	GTG	2	6	9330	9335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
103	NC_009928	CCA	2	6	9475	9480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340468
104	NC_009928	AAG	2	6	9495	9500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
105	NC_009928	TGG	2	6	9519	9524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
106	NC_009928	GCC	2	6	9609	9614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340468
107	NC_009928	GAA	3	9	9648	9656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
108	NC_009928	GAC	2	6	9715	9720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340468
109	NC_009928	GTG	2	6	9756	9761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
110	NC_009928	GCC	2	6	9828	9833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340468
111	NC_009928	AAG	2	6	9897	9902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
112	NC_009928	CAA	2	6	9909	9914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340468
113	NC_009928	GTG	2	6	9915	9920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
114	NC_009928	TGAA	2	8	10114	10121	50 %	25 %	25 %	0 %	158340468
115	NC_009928	TTG	2	6	10277	10282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340468
116	NC_009928	ATA	2	6	10655	10660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340469
117	NC_009928	TTC	2	6	10693	10698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340469
118	NC_009928	AT	3	6	10722	10727	50 %	50 %	0 %	0 %	158340469
119	NC_009928	ACA	2	6	10731	10736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340469
120	NC_009928	TAT	2	6	10737	10742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340469
121	NC_009928	CTT	2	6	10749	10754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340469
122	NC_009928	GAAA	2	8	10780	10787	75 %	0 %	25 %	0 %	158340469
123	NC_009928	CAA	2	6	10822	10827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340469
124	NC_009928	GAT	2	6	10835	10840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340469
125	NC_009928	T	7	7	10999	11005	0 %	100 %	0 %	0 %	158340469
126	NC_009928	CTG	3	9	11070	11078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340469
127	NC_009928	AAG	2	6	11089	11094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340469
128	NC_009928	AAGAC	2	10	11116	11125	60 %	0 %	20 %	20 %	158340469
129	NC_009928	GTT	2	6	11162	11167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340469
130	NC_009928	CATT	2	8	11175	11182	25 %	50 %	0 %	25 %	158340469
131	NC_009928	ATGAG	2	10	11207	11216	40 %	20 %	40 %	0 %	158340469
132	NC_009928	AG	3	6	11232	11237	50 %	0 %	50 %	0 %	158340469
133	NC_009928	TAA	2	6	11290	11295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340469
134	NC_009928	TGA	2	6	11321	11326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340469
135	NC_009928	ACG	2	6	11375	11380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340469
136	NC_009928	C	6	6	11486	11491	0 %	0 %	0 %	100 %	158340469
137	NC_009928	GAAC	2	8	11499	11506	50 %	0 %	25 %	25 %	158340469
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140	NC_009928	TGG	2	6	11645	11650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340469
141	NC_009928	TGA	2	6	11739	11744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340469
142	NC_009928	TCTG	2	8	11748	11755	0 %	50 %	25 %	25 %	158340469
143	NC_009928	TGA	2	6	11775	11780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340469
144	NC_009928	AAT	2	6	11846	11851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340469
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151	NC_009928	ACTG	2	8	12312	12319	25 %	25 %	25 %	25 %	158340469
152	NC_009928	AG	3	6	12424	12429	50 %	0 %	50 %	0 %	158340469
153	NC_009928	GCA	2	6	12441	12446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340469
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156	NC_009928	TTC	2	6	12496	12501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340469
157	NC_009928	ACC	2	6	12548	12553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340469
158	NC_009928	TTG	2	6	12604	12609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340469
159	NC_009928	TCA	2	6	13096	13101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340470
160	NC_009928	TCT	2	6	13107	13112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340470
161	NC_009928	CCCTCA	2	12	13120	13131	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158340470
162	NC_009928	CTC	2	6	13221	13226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340470
163	NC_009928	TAC	2	6	13249	13254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340470
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166	NC_009928	CTC	2	6	13325	13330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340470
167	NC_009928	CTC	2	6	13340	13345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340470
168	NC_009928	ACC	2	6	13475	13480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340470
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172	NC_009928	TTTG	2	8	13599	13606	0 %	75 %	25 %	0 %	158340470
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174	NC_009928	CA	3	6	13676	13681	50 %	0 %	0 %	50 %	158340470
175	NC_009928	TCA	2	6	13698	13703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340470
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232	NC_009928	ACA	2	6	17071	17076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340473
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241	NC_009928	AGA	2	6	17528	17533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340473
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244	NC_009928	TGT	2	6	17724	17729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340473
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246	NC_009928	CAA	2	6	17780	17785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340473
247	NC_009928	GTT	2	6	17839	17844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340473
248	NC_009928	CAA	2	6	17921	17926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340473
249	NC_009928	TCC	2	6	17984	17989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340473
250	NC_009928	CAG	2	6	18026	18031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340473
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252	NC_009928	CGA	2	6	18337	18342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340474
253	NC_009928	T	6	6	18391	18396	0 %	100 %	0 %	0 %	158340474
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260	NC_009928	CTGA	2	8	18979	18986	25 %	25 %	25 %	25 %	158340474
261	NC_009928	CACG	2	8	18995	19002	25 %	0 %	25 %	50 %	158340474
262	NC_009928	GCT	2	6	19054	19059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340474
263	NC_009928	TCT	2	6	19063	19068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340474
264	NC_009928	CCA	2	6	19097	19102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340474
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266	NC_009928	TGGA	2	8	19160	19167	25 %	25 %	50 %	0 %	158340474
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270	NC_009928	ATT	2	6	19306	19311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340474
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275	NC_009928	ATT	2	6	19498	19503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340474
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382	NC_009928	TTGA	2	8	27097	27104	25 %	50 %	25 %	0 %	158340483
383	NC_009928	G	6	6	27116	27121	0 %	0 %	100 %	0 %	158340483
384	NC_009928	TG	3	6	27297	27302	0 %	50 %	50 %	0 %	158340483
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388	NC_009928	CTT	3	9	27927	27935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340483
389	NC_009928	AAC	2	6	28024	28029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340483
390	NC_009928	ACTTAG	2	12	28200	28211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158340483
391	NC_009928	GCG	2	6	28251	28256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340483
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395	NC_009928	TTG	2	6	30516	30521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340485
396	NC_009928	GCTTG	2	10	30547	30556	0 %	40 %	40 %	20 %	158340485
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499	NC_009928	GGAT	2	8	36384	36391	25 %	25 %	50 %	0 %	158340489
500	NC_009928	GCA	2	6	36406	36411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340489

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